港鐵公司在發展鐵路的同時，非常重視並會充分考慮保護環境的需要。屯門南延綫項目以此為基礎，在工程規劃及設計上，盡力減低對周邊環境及社區的影響，例如盡量減少使用屯門公園用地作為施工範圍。

工程期間，港鐵公司一直謹慎處理沿綫的樹木，優先考慮原址保留。如果因空間限制或施工需要而無可避免須移除或移植樹木，則會按照政府發出有關保育樹木的技術通告及作業備考，提交移除樹木申請及補償種植安排予相關政府部門審批。

為減少浪費木資源，樹木移除後合適部分會送往回收中心Y·PARK [林·區] 用作回收及升級再造，給予木材第二生命，轉化為有用的再生產品，例如建築用木板、木傢俬、藝術及裝飾品、園藝和種植用的堆肥和覆蓋物等。

樹木移除後合適的部分送往回收中心升級再造

工程完成後，項目團隊將按照政府有關保育樹木的技術通告之指引，以原區優先的原則補種樹木。港鐵公司會繼續與相關政府部門洽商妥善的安排，在合適的位置補種樹木。

建造工程貫徹環保概念

工程團隊會儘量採用預製組件，減省現場施工工序對環境的影響，避免浪費建築材料，提升車站可持續性。除此以外，公司亦積極考慮使用更環保的建築材料，以進一步減少項目工程的碳足跡。